«После громкого заявления Чаплина о том, что наши войска ведут в Сирии священную войну с террором — а это заявление разошлось по всему миру, в том числе, к сожалению, и в мусульманской среде, где оно было воспринято как объявление крестового похода, — Чаплину было высказано неудовольствие из МИДа. Я думаю, что в данном случае политика патриархии просто пришла в соответствие с пожеланиями нашего правительства. То есть это не знак пересмотра политики патриархии, тут нет никаких тайных сигналов, это обычный знак того, что все согласовано», — заявил он.

При этом Кураев предположил, что все заявления, которые делал Чаплин, согласовывались с патриархом Кириллом.

«Характер патриарха Кирилла таков, что он умеет жестко донести до подчиненного необходимость полного послушания и единомыслия. И с не удовлетворяющими его подчиненными он расстается легко. Чаплина терпели долго. Значит, передаваемый им сигнал соответствовал оригиналу», — сказал Кураев.

Решение об отставке Чаплина было принято Священным синодом 24 декабря. В РПЦ сообщили, что отдел по взаимоотношениям церкви и общества, который возглавлял Чаплин, будет объединен с информационным отделом. Председателем новообразованной структуры назначен Владимир Легойда, до настоящего времени возглавлявший информационный отдел.

Сам Чаплин связал свое увольнение со своими разногласиями с патриархом Кириллом. «Мы достаточно серьёзно разошлись с его святейшеством в понимании того, какова должна быть роль церкви в государстве и обществе. Я считаю, что мы должны быть независимы, мы должны критически вести диалог с властью, не поддакивать ей, спорить с ней, спорить с обществом, даже если кто-то не соглашается с тем, что верующие люди говорят», — рассказал Чаплин в интервью «Русской службы новостей». В интервью «Дождю» он заявил, что в церкви не хотят видеть палитры мнений.