Первой режиссёрской работой, которая сделала Хуциева известным, стал фильм «Весна на Заречной улице» (1956). А шедеврами советского кинематографа 1960-х годов стали его ленты: «Мне двадцать лет» (1962, в первоначальнйо редакции — «Застава Ильича»), «Июльский дождь» (1967).

В поледующие годы на экран вышли фильмы — «Был месяц май» (1970), «Алый парус Парижа» (1971), «Послесловие» (1983), «Бесконечность» (1991) и «Невечерняя» (2006). Работал Хуциев и как актёр и как театрильный режиссёр.

Кроме того, с 1978 года он преподаёт во ВГИКе. Многие его ученики сегодня служат в кино и на телевидении. В 1978—2009 годах Хуциев руководил мастерской режиссуры игрового кино во ВГИКе, а в 1987—2009 годах возглавил одноименную кафедру. Профессор Хуциев также является президентом Гильдии кинорежиссеров России, президентом Международного правозащитного кинофестиваля «Сталкер», действительным членом Российской Академии гуманитарных наук, почетным членом Российской академии художеств и т. д. Он неоднократно избирался секретарем Союза кинематографистов СССР.

Марлен Хуциев — Народный артист СССР, лауреат Государственной премии СССР и РФ, лауреат премий «Золотой Овен», «Триумф» и «Ника», обладатель приза города Санкт-Петербурга «Живая легенда отечественного кино», премии мэрии Москвы за уникальный вклад в развитие культуры, Национальной премии в области документального кино и телевидения «Лавровая ветвь». Он награжден орденами «За заслуги перед Отечеством» IV, III и II степеней, «Знак Почета» и другими орденами и медалями.