Елисееву инкриминируются преступления по ч.1 ст. 111 и ч.1 ст. 408 Уголовного кодекса Украины (государственная измена и дезертирство). Статьи предусматривают наказание в виде лишения свободы на срок от 2 до 15 лет.
​
Елисеева подозревают в том, что в феврале-марте 2014 года он изменил военной присяге и «с целью содействия иностранной оккупации территории Крыма» дезертировал со службы.

Затем Елисеев поступил на военную службу в Россию и сейчас находится на должности заместителя командующего Балтийским флотом ВМФ России. Украинская прокуратура отмечает, что, находясь на должности в российской армии, Елисеев «способствует подрывной деятельности против Украины».

В ближайшее время украинская прокуратура планирует начать специальное расследование и заочно осудить Елисеева.